BRCA1

bioentity information

Alternative Names
BRCA1
BRCAI
breast cancer 1, early onset
IRIS
Breast cancer type 1 susceptibility protein

recently added documents

Pubmed ( 4,402 ) Free Full Text ( 1,098 )   U.S. Grants ( 884 )  

2010-10-01	BRCA1 negatively regulates formation of autophagic vacuoles in MCF-7 breast cancer cells.
2010-09-28	Cloning and characterization of a new BRCA1 variant: A role for BRCT domains in apoptosis.
2010-09-01	Expression of TRF1, TRF2, TIN2, TERT, KU70, and BRCA1 proteins is associated with telomere shortening and may contribute to multistage carcinogenesis of gastric cancer.
2010-09-01	PARP inhibition: targeting the Achilles' heel of DNA repair to treat germline and sporadic ovarian cancers.
2010-09-01	Secretory cell outgrowth, PAX2 and serous carcinogenesis in the Fallopian tube.

links to other databases

Categories	Databases Identifiers
Genomic Information	entrezgene 672 hgnc 1100 pharmgkb PA25411 h-invdb HIX0039035 homologene Mouse, Rat (5276) mgc BC115037
Nucleotide Sequence	refseq NW_001838436 ,  NT_010755 ,  NM_007294 ,  NM_007298 ,  NM_007302 ,  NP_009225.1 ,  NM_007300 ,  AC_000060 ,  NM_007304 ,  NC_000017 ,  NP_009226.1 ,  NP_009227.1 ,  NW_926828 ,  NM_007296 ,  NG_005905 ,  AC_000149 ,  NM_007297 ,  NM_007305 ,  NM_007303 ,  NM_007295 ,  NM_007299 ,  NP_009235.2 ,  NP_009228.1 genbank CH471152 ,  AF005068 ,  AF507076 ,  AY304547 ,  DQ299323 ,  DQ299327 ,  BU617173 ,  DQ190455 ,  DQ299307 ,  DQ299316 ,  AY093484 ,  DQ145823 ,  AY093490 ,  DQ190450 ,  DQ299313 ,  BC106745 ,  DQ299317 ,  AY706912 ,  DQ190454 ,  DQ145825 ,  DQ299309 ,  BC038947 ,  DQ299312 ,  AC135721 ,  U61268 ,  AY093486 ,  DQ299305 ,  AL701927 ,  L78833 ,  DQ190456 ,  DQ299315 ,  BC030969 ,  DQ299311 ,  DQ190451 ,  BC106746 ,  DQ190452 ,  BC085615 ,  AY093492 ,  BC062429 ,  DQ299319 ,  AK293762 ,  AF507078 ,  DQ299331 ,  DQ116737 ,  BC046142 ,  DQ299329 ,  BC012577 ,  AK307553 ,  DQ299325 ,  DQ299321 ,  DQ299306 ,  AF274503 ,  AK308084 ,  DQ299328 ,  U15595 ,  DQ299324 ,  AY144588 ,  DQ299330 ,  AK316200 ,  DQ190453 ,  BC114511 ,  DQ299310 ,  DQ299314 ,  AY706911 ,  DQ190457 ,  AY093489 ,  DQ299318 ,  AY093493 ,  AY093487 ,  DQ299308 ,  U37574 ,  BC072418 ,  DQ145826 ,  AY093485 ,  DQ145822 ,  U64805 ,  U14680 ,  DQ478408 ,  DQ299326 ,  AF284812 ,  DQ299322 ,  AY273801 ,  AY354539 ,  BC114562 ,  AY751490 ,  Y08757 ,  U68041 unigene Hs.194143 (194143) ,  Hs.194143 unists 157172 ,  157176 ,  272396 ,  157436 ,  157432 ,  272804 ,  157163 ,  272808 ,  157167 ,  157173 ,  158446 ,  157177 ,  90392 ,  157426 ,  150079 ,  157427 ,  270874 ,  157165 ,  147918 ,  464465 ,  157438 ,  157161 ,  157169 ,  482866 ,  157430 ,  272806 ,  157434 ,  272802 ,  158401 ,  270193 ,  157179 ,  473907 ,  157424 ,  157175 ,  1986 ,  155756 ,  157428 ,  157171 ,  157159 ,  49519 ,  262743 ,  157441 ,  157433 ,  173306 ,  272805 ,  474482 ,  157440 ,  56291 ,  157437 ,  272801 ,  158402 ,  157425 ,  151019 ,  157178 ,  157170 ,  157429 ,  157174 ,  150080 ,  157439 ,  157164 ,  157435 ,  157431 ,  272807 ,  157168 ,  270877 ,  157162 ,  272397 ,  137300 ,  157442 ,  149621
Protein Sequence	uniprot Q8IZT7 ,  Q3LRH8 ,  Q3YB52 ,  Q7KYU6 ,  Q3YB53 ,  Q8IZK4 ,  Q4EW25 ,  P38398 ,  Q6IN79 ,  Q6P671 ,  Q1RMC1 ,  Q05BZ9 ,  O15129 ,  Q64FK2 ,  Q5XLT4 ,  Q3B890 ,  Q3YB51 ,  Q3YB49 ,  Q8IZK2 ,  Q5U3B7 ,  Q8IZK3 ,  Q3YB50 ,  Q7KYU9 ,  Q3B891 ,  Q3LRJ0 ,  Q5YLB2 ,  Q8IU58 ,  Q9UE29 ,  Q3LRJ6 ,  Q7Z606 ,  Q9NQR3 ,  Q64FK3 ,  Q92897 entrezprotein ABB87055 ,  AAA73985 ,  EAW60932 ,  AAN61423 ,  CAA70003 ,  ABB87058 ,  ABB87079 ,  AAB61673 ,  EAW60933 ,  ABB87054 ,  EAW60937 ,  AAB40910 ,  ABB87071 ,  AAQ92977 ,  EAW60923 ,  ABA29229 ,  EAW60927 ,  ABB87064 ,  AAZ79406 ,  AAZ16492 ,  AAH62429 ,  ABB87060 ,  AAH85615 ,  AAH30969 ,  AAI06746 ,  AAC37594 ,  ABF14462 ,  ABA29211 ,  EAW60942 ,  ABB87078 ,  ABB87074 ,  AAP70031 ,  AAM18222 ,  AAC00049 ,  AAM18226 ,  ABA29214 ,  ABB87070 ,  AAM18223 ,  AAU93634 ,  AAC50330 ,  ABB87062 ,  AAP12647 ,  ABB87066 ,  ABB87072 ,  AAZ79410 ,  AAM18220 ,  ABB87076 ,  ABA29217 ,  BAG57181 ,  ABB87075 ,  BAH14571 ,  EAW60940 ,  EAW60935 ,  ABB87056 ,  EAW60931 ,  EAW60939 ,  AAN61425 ,  ABB87061 ,  EAW60929 ,  AAM18218 ,  ABA29208 ,  ABA29223 ,  AAU21563 ,  EAW60925 ,  ABA29226 ,  AAM18219 ,  EAW60928 ,  EAW60924 ,  EAW60930 ,  ABB87057 ,  ABB87053 ,  EAW60934 ,  AAZ79407 ,  EAW60938 ,  ABB87065 ,  ABB87077 ,  AAM18221 ,  AAM18225 ,  ABB87073 ,  EAW60941 ,  AAI15038 ,  AAB08105 ,  AAZ79409 ,  ABB87067 ,  AAF97939 ,  ABB87063 ,  AAI06747 ,  ABB87069 ,  EAW60926 ,  AAU21564 ,  EAW60922 ,  ABA29220 ,  AAN10167 ,  ABB87059 ,  AAH72418 ,  EAW60936 hprd 00218 refseqprotein NP_009236 ,  NP_009226 ,  NP_009234 ,  NP_009230 ,  NP_009228 ,  NP_009225 ,  NP_009229 ,  NP_009231 ,  NP_009235 ,  NP_009227 ,  NP_009233 pir A58881
Protein Family/Domain	pfam PF00533 interpro IPR001841 ,  IPR013083 ,  IPR001357 ,  IPR002378 ,  IPR017907 ,  IPR011364 prosite PS00518 ,  PS50089 ,  PS50172 smart SM00184 ,  SM00292 pirsf PIRSF001734 prints PR00493
Structure	pdb 3COJ ,  1N5O ,  1T2V ,  2ING ,  1T15 ,  1T29 ,  1OQA ,  1JM7 ,  1T2U ,  1JNX ,  1Y98 gene3d G3DSA:3.30.40.10
Pathway/Interaction	reactome REACT_216 ,  73894 panther PTHR13763 kegg hsa:672
Microarray	affymetrix 204531_s_at ,  83730_at germonline ENSG00000012048
Ontology	go nucleoplasm (5654) ,  ubiquitin-protein ligase activity (4842) ,  centrosome cycle (7098) ,  androgen receptor signaling pathway (30521) ,  molecular_function (3674) ,  protein binding (5515) ,  postreplication repair (6301) ,  DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator (6978) ,  positive regulation of protein ubiquitination (31398) ,  negative regulation of fatty acid biosynthetic process (45717) ,  response to DNA damage stimulus (6974) ,  condensed chromosome (793) ,  BRCA1-BARD1 complex (31436) ,  DNA replication (6260) ,  gamma-tubulin ring complex (8274) ,  zinc ion binding (8270) ,  cell cycle checkpoint (75) ,  cytoplasm (5737) ,  DNA repair (6281) ,  chromosome segregation (7059) ,  transcription coactivator activity (3713) ,  negative regulation of centriole replication (46600) ,  regulation of apoptosis (42981) ,  negative regulation of cell cycle (45786) ,  enzyme binding (19899) ,  regulation of cell proliferation (42127) ,  double-strand break repair via homologous recombination (724) ,  nucleus (5634) ,  regulation of transcription from RNA polymerase II promoter (6357) ,  DNA binding (3677) ,  positive regulation of transcription, DNA-dependent (45893) ,  chordate embryonic development (43009) ,  damaged DNA binding (3684) ,  positive regulation of DNA repair (45739) ,  intracellular (5622) ,  DNA damage response, signal transduction resulting in induction of apoptosis (8630) ,  negative regulation of transcription (16481) ,  identical protein binding (42802) ,  tubulin binding (15631) ,  cellular_component (5575) ,  dosage compensation, by inactivation of X chromosome (9048) ,  ubiquitin ligase complex (151) ,  regulation of transcription from RNA polymerase III promoter (6359) ,  response to estrogen stimulus (43627) ,  metal ion binding (46872) ,  androgen receptor binding (50681)
Bibliography	omim 113705 ,  Breast-ovarian cancer, familial, 1 (604370) wikipedia BRCA1 entry (http://en.wikipedia.org/wiki/BRCA1) mim 114480 dip DIP:5971N gene_reviews http://www.genetests.org/query?gene=BRCA1